Luận án tiến sĩ: Khả năng kháng carbapenem ở vi khuẩn Gram âm tại bệnh viện Việt Đức và 108 (2018)

Nghiên cứu khả năng kháng carbapenem ở vi khuẩn Gram âm năm 2018, cung cấp dữ liệu quan trọng về tình trạng kháng kháng sinh nguy hiểm này.

Trường ĐH
Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội
Chuyên ngành
Vi sinh vật học
Tác giả

Luan An

Thể loại

Luận án tiến sĩ sinh học

Năm xuất bản

Số trang

201

Thời gian đọc

31 phút

Lượt xem

0

Lượt tải

0

Phí lưu trữ

50 Point

Tổng quan nhanh

Chủ đề:
Tổng quan Kháng Carbapenem ở Vi khuẩn Gram âm (2018)
Số trang:
201 trang
Trường:
Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội
Chuyên ngành:
Vi sinh vật học
Tác giả:
Năm:

Tóm tắt nội dung luận án

I.Tổng quan Kháng Carbapenem ở Vi khuẩn Gram âm 2018

Đề kháng kháng sinh là thách thức y tế toàn cầu. Vi khuẩn Gram âm kháng carbapenem đặc biệt nguy hiểm. Carbapenem là nhóm kháng sinh mạnh, thường là lựa chọn cuối cùng cho các nhiễm trùng nghiêm trọng. Sự xuất hiện và lan rộng của các chủng kháng carbapenem đe dọa nghiêm trọng khả năng điều trị các bệnh nhiễm trùng cấp tính. Nghiên cứu tập trung vào việc hiểu sâu hơn về cơ chế phân tử của hiện tượng này. Mục tiêu là cung cấp dữ liệu quan trọng cho các chiến lược kiểm soát. Thông tin này giúp các nhà lâm sàng và chuyên gia y tế công cộng đối phó hiệu quả với tình hình đề kháng ngày càng phức tạp.

1.1. Hiện trạng Đề kháng Kháng sinh toàn cầu

Mối lo ngại về đề kháng kháng sinh đang gia tăng nhanh chóng. Kháng sinh thế hệ mới phát triển chậm. Nhiều chủng vi khuẩn Gram âm đã phát triển khả năng kháng carbapenem. Điều này làm giảm đáng kể hiệu quả điều trị. Các bệnh nhân nhiễm trùng bởi vi khuẩn kháng thuốc phải đối mặt với nguy cơ tử vong cao hơn. Chi phí điều trị cũng tăng lên. Cần có những giải pháp cấp bách để hạn chế sự lan truyền của đề kháng. Phải tăng cường giám sát và kiểm soát ở cấp độ toàn cầu. Các tổ chức y tế kêu gọi hành động chung.

1.2. Tầm quan trọng của Vi khuẩn Gram âm kháng thuốc

Vi khuẩn Gram âm là nguyên nhân hàng đầu gây nhiễm trùng bệnh viện. Chúng bao gồm các loài như Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, và Acinetobacter baumannii. Các chủng này thường biểu hiện đa kháng kháng sinh. Kháng carbapenem ở các vi khuẩn này là một vấn đề đặc biệt nghiêm trọng. Kháng thuốc khiến việc lựa chọn phác đồ điều trị trở nên khó khăn. Điều này dẫn đến kéo dài thời gian nằm viện, tăng biến chứng. Bệnh nhân có thể phải dùng thuốc kém hiệu quả hơn, độc hơn. Kiểm soát vi khuẩn Gram âm kháng thuốc là ưu tiên hàng đầu trong y tế.

1.3. Carbapenem và Cơ chế Kháng Carbapenem

Carbapenem là kháng sinh beta-lactam phổ rộng. Chúng có khả năng tiêu diệt nhiều loại vi khuẩn. Tuy nhiên, vi khuẩn đã phát triển các cơ chế kháng. Cơ chế chính là sản xuất enzyme carbapenemase. Các enzyme này thủy phân carbapenem, làm chúng mất hoạt tính. Các gen carbapenemase phổ biến bao gồm KPC, NDM, OXA-48, VIM, và IMP. Ngoài ra, vi khuẩn có thể kháng carbapenem thông qua giảm tính thấm màng ngoài. Bơm tống thuốc cũng là một cơ chế kháng khác. Sự kết hợp của nhiều cơ chế làm cho đề kháng trở nên phức tạp.

II.Mục tiêu Nghiên cứu Đề kháng Kháng sinh Carbapenem 2018

Nghiên cứu được thực hiện để đánh giá tình hình kháng carbapenem ở vi khuẩn Gram âm. Vi khuẩn được phân lập từ bệnh nhân tại các bệnh viện lớn ở Việt Nam. Mục tiêu chính là xác định các gen kháng carbapenemase ở cấp độ phân tử. Từ đó, hiểu rõ hơn về dịch tễ học của đề kháng. Nghiên cứu cung cấp cơ sở khoa học để phát triển các biện pháp kiểm soát. Dữ liệu này hỗ trợ các chính sách y tế công cộng. Giúp đối phó hiệu quả với mối đe dọa từ vi khuẩn kháng thuốc.

2.1. Xác định Tỷ lệ Kháng Carbapenem tại Bệnh viện

Một mục tiêu quan trọng là khảo sát tỷ lệ vi khuẩn Gram âm kháng carbapenem. Các mẫu được thu thập từ Bệnh viện Việt Đức và Bệnh viện Trung ương Quân đội 108. Các bệnh viện này là tuyến đầu, tiếp nhận nhiều ca bệnh nặng. Dữ liệu từ đây phản ánh chân thực tình hình lâm sàng. Việc xác định tỷ lệ này giúp đánh giá mức độ nghiêm trọng của vấn đề. Thông tin này cần thiết cho việc xây dựng hướng dẫn điều trị. Nó cũng cảnh báo về mức độ lây lan của đề kháng.

2.2. Phân tích Cơ chế Phân tử Kháng Carbapenemase

Nghiên cứu đi sâu vào cơ chế kháng ở cấp độ phân tử. Việc xác định các gen carbapenemase là trọng tâm. Các gen như KPC, NDM, OXA-48, VIM, IMP được phân tích. Hiểu biết về các gen này giúp giải thích sự biểu hiện kháng thuốc. Nó cũng giúp theo dõi sự tiến hóa của đề kháng. Phân tích phân tử cung cấp thông tin chi tiết. Dữ liệu này không thể có được chỉ bằng phương pháp nuôi cấy thông thường. Điều này hỗ trợ chẩn đoán chính xác hơn.

2.3. Đánh giá Đặc điểm Dịch tễ học Phân tử Vi khuẩn

Mục tiêu tiếp theo là đánh giá đặc điểm dịch tễ học phân tử của các chủng kháng thuốc. Theo dõi sự phân bố của gen kháng carbapenemase. Nghiên cứu này xác định các chủng vi khuẩn mang gen kháng. Nó cũng phân tích mối liên hệ dịch tễ giữa các chủng. Dữ liệu dịch tễ học phân tử rất quan trọng. Nó giúp hiểu cách vi khuẩn và gen kháng lan truyền trong cộng đồng và bệnh viện. Từ đó, đưa ra các biện pháp kiểm soát nhiễm khuẩn phù hợp.

III.Phương pháp Phát hiện Gen Kháng Carbapenemase 2018

Nghiên cứu sử dụng nhiều phương pháp hiện đại. Các phương pháp này được áp dụng để phát hiện và đặc trưng hóa khả năng kháng carbapenem. Từ việc thu thập và định danh vi khuẩn đến các kỹ thuật sinh học phân tử tiên tiến. Việc kết hợp các kỹ thuật khác nhau đảm bảo tính chính xác và toàn diện của kết quả. Các bước được thực hiện cẩn thận. Mục tiêu là thu được dữ liệu đáng tin cậy. Dữ liệu này giúp hiểu rõ hơn về các chủng vi khuẩn Gram âm kháng carbapenem.

3.1. Thu thập Mẫu và Định danh Vi khuẩn Gram âm

Các mẫu vi khuẩn được thu thập từ bệnh nhân. Nguồn gốc từ Bệnh viện Việt Đức và Bệnh viện Trung ương Quân đội 108. Đây là các bệnh viện lớn, có lượng bệnh nhân lớn. Vi khuẩn Gram âm được phân lập từ các mẫu bệnh phẩm khác nhau. Sau đó, chúng được định danh bằng các phương pháp vi sinh chuẩn. Đảm bảo xác định chính xác loài vi khuẩn. Bước này là nền tảng cho các phân tích tiếp theo. Nó cung cấp các chủng vi khuẩn phù hợp để nghiên cứu.

3.2. Xét nghiệm Độ nhạy Kháng sinh và Phát hiện Kháng Carbapenem

Sau khi định danh, các chủng vi khuẩn được kiểm tra độ nhạy kháng sinh. Sử dụng phương pháp khuếch tán đĩa (Kirby-Bauer) hoặc xác định nồng độ ức chế tối thiểu (MIC). Các phương pháp này xác định khả năng kháng carbapenem. Kết quả phân loại chủng vi khuẩn thành nhạy, trung gian hoặc kháng. Bước này rất quan trọng để chọn lọc các chủng kháng carbapenem. Chỉ các chủng kháng mới được phân tích sâu hơn ở cấp độ phân tử.

3.3. Giải trình tự Gen Kháng Carbapenemase

Kỹ thuật phản ứng chuỗi polymerase (PCR) được sử dụng. PCR phát hiện sự hiện diện của các gen carbapenemase. Các gen mục tiêu bao gồm KPC, NDM, OXA-48, VIM, IMP. Sau đó, giải trình tự Sanger hoặc giải trình tự toàn bộ hệ gen (WGS) được thực hiện. WGS cung cấp thông tin chi tiết về toàn bộ hệ gen vi khuẩn. Nó giúp xác định chính xác các biến thể gen. WGS cũng hỗ trợ phân tích mối quan hệ phát sinh chủng loại. Các kỹ thuật này là công cụ mạnh mẽ để hiểu về đề kháng ở cấp độ phân tử.

IV.Kết quả chính về Carbapenemase trong Enterobacteriaceae 2018

Nghiên cứu đã thu được nhiều kết quả quan trọng. Đặc biệt là về sự hiện diện và phân bố của các gen carbapenemase. Phát hiện này giúp định hình bức tranh về đề kháng kháng sinh tại Việt Nam. Nó nhấn mạnh tầm quan trọng của việc giám sát liên tục. Các kết quả cung cấp dữ liệu cụ thể về các gen kháng. Điều này giúp các nhà khoa học và y tế tập trung vào các chủng vi khuẩn và gen gây lo ngại nhất. Dữ liệu này hỗ trợ cho việc xây dựng các biện pháp phòng ngừa và điều trị hiệu quả hơn.

4.1. Phát hiện Gen NDM 1 ở Vi khuẩn Enterobacteriaceae

Nghiên cứu đã xác định sự hiện diện của gen NDM-1. Gen này được tìm thấy trong nhiều chủng Enterobacteriaceae kháng carbapenem. NDM-1 là một loại carbapenemase đặc biệt nguy hiểm. Nó có khả năng thủy phân gần như tất cả các kháng sinh beta-lactam. Sự lan truyền của NDM-1 gây ra mối đe dọa lớn. Nó làm phức tạp việc điều trị các bệnh nhiễm trùng. Phát hiện này khẳng định sự phổ biến của NDM-1 tại các bệnh viện Việt Nam. Cần có biện pháp kiểm soát nghiêm ngặt.

4.2. Sự phân bố Gen Carbapenemase trong Klebsiella pneumoniae

Klebsiella pneumoniae là một trong những loài vi khuẩn Gram âm quan trọng nhất. Nghiên cứu cho thấy nhiều chủng Klebsiella pneumoniae mang gen carbapenemase. Các gen phổ biến như KPC, NDM, và OXA-48 đã được tìm thấy. Sự hiện diện đa dạng của các gen này trong Klebsiella pneumoniae là đáng lo ngại. Loài vi khuẩn này thường gây nhiễm trùng bệnh viện nghiêm trọng. Khả năng kháng carbapenem của nó làm tăng tỷ lệ tử vong. Cần giám sát chặt chẽ các chủng Klebsiella pneumoniae kháng thuốc.

4.3. Các chủng Vi khuẩn Gram âm Kháng Carbapenem khác

Ngoài Enterobacteriaceae, nghiên cứu cũng xem xét các vi khuẩn Gram âm khác. Pseudomonas aeruginosa và Acinetobacter baumannii cũng được phân tích. Các chủng này cũng cho thấy khả năng kháng carbapenem đáng kể. Các gen kháng liên quan đến carbapenemase được xác định trong các loài này. Pseudomonas aeruginosa và Acinetobacter baumannii là nguyên nhân phổ biến gây nhiễm trùng bệnh viện. Khả năng kháng thuốc của chúng tạo ra thách thức điều trị lớn. Cần có các chiến lược kiểm soát riêng biệt cho các loài này.

V.Lan truyền Gen Kháng Carbapenem ở Vi khuẩn Gram âm 2018

Sự lan truyền của gen kháng carbapenem là một vấn đề phức tạp. Nó liên quan đến nhiều yếu tố di truyền và môi trường. Nghiên cứu đã cung cấp cái nhìn sâu sắc về cơ chế lây lan này. Hiểu rõ cách các gen kháng di chuyển giữa các vi khuẩn và giữa các bệnh nhân là rất quan trọng. Điều này giúp xây dựng các biện pháp ngăn chặn hiệu quả hơn. Các dữ liệu này cung cấp cơ sở cho việc kiểm soát sự lây lan của các chủng vi khuẩn đa kháng.

5.1. Vai trò của Plasmid trong Lan truyền Gen Kháng Carbapenemase

Gen kháng carbapenemase thường nằm trên plasmid. Plasmid là các phân tử DNA vòng độc lập. Chúng có thể dễ dàng chuyển giao giữa các tế bào vi khuẩn. Quá trình này được gọi là tiếp hợp. Tiếp hợp là một cơ chế chính thúc đẩy sự lan truyền nhanh chóng của đề kháng kháng sinh. Một plasmid có thể mang nhiều gen kháng. Điều này cho phép vi khuẩn kháng nhiều loại kháng sinh cùng lúc. Kiểm soát sự lan truyền của plasmid là trọng tâm trong cuộc chiến chống đề kháng.

5.2. Phân tích Klon Vi khuẩn Kháng Carbapenem

Nghiên cứu sử dụng các kỹ thuật như MLST (Multilocus Sequence Typing) hoặc WGS. Các kỹ thuật này giúp xác định các klon (dòng vô tính) vi khuẩn kháng carbapenem. Phân tích klon giúp theo dõi sự lây lan của các chủng vi khuẩn cụ thể. Điều này cho phép xác định các ổ dịch tiềm năng. Nó cũng giúp hiểu về các con đường lây truyền trong bệnh viện. Thông tin này rất quan trọng để thực hiện các biện pháp kiểm soát nhiễm khuẩn hiệu quả.

5.3. Các yếu tố Môi trường ảnh hưởng đến Đề kháng Kháng sinh

Môi trường bệnh viện là nơi tập trung vi khuẩn kháng thuốc. Sử dụng kháng sinh không hợp lý tạo áp lực chọn lọc mạnh mẽ. Việc này thúc đẩy sự phát triển của các chủng kháng thuốc. Vệ sinh kém và quy trình kiểm soát nhiễm khuẩn lỏng lẻo cũng góp phần vào sự lan truyền. Các yếu tố này tạo điều kiện cho vi khuẩn kháng carbapenem phát triển. Hiểu rõ các yếu tố môi trường giúp thiết lập các chiến lược phòng ngừa. Các chiến lược này bao gồm tăng cường vệ sinh và quản lý kháng sinh.

VI.Ý nghĩa Nghiên cứu Kháng Carbapenem cho Y tế công cộng 2018

Nghiên cứu này có ý nghĩa to lớn đối với y tế công cộng. Nó cung cấp bằng chứng khoa học về tình hình đề kháng kháng sinh tại Việt Nam. Các kết quả giúp định hướng các chiến lược quốc gia. Mục tiêu là kiểm soát sự lan rộng của vi khuẩn Gram âm kháng carbapenem. Nghiên cứu cũng góp phần nâng cao nhận thức. Nó thúc đẩy các hành động cần thiết từ cộng đồng y tế và người dân. Các kết quả là cơ sở để cải thiện chất lượng chăm sóc sức khỏe.

6.1. Đóng góp vào Chiến lược Kiểm soát Đề kháng Kháng sinh

Dữ liệu từ nghiên cứu cung cấp cơ sở vững chắc. Nó hỗ trợ xây dựng và điều chỉnh các chiến lược quốc gia về kiểm soát đề kháng kháng sinh. Đặc biệt đối với vi khuẩn Gram âm kháng carbapenem. Các phát hiện này giúp ưu tiên các biện pháp can thiệp. Chúng giúp phân bổ nguồn lực hiệu quả hơn. Mục tiêu là giảm thiểu tác động của đề kháng. Điều này bao gồm phát triển các hướng dẫn điều trị mới.

6.2. Cải thiện Chẩn đoán và Điều trị Nhiễm trùng

Hiểu rõ hơn về cơ chế kháng thuốc giúp cải thiện quy trình chẩn đoán. Phát triển các xét nghiệm nhanh và chính xác hơn là khả thi. Các xét nghiệm này có thể phát hiện gen kháng carbapenemase. Điều này giúp lựa chọn kháng sinh phù hợp ngay từ đầu. Chẩn đoán và điều trị kịp thời, chính xác giúp tăng tỷ lệ thành công. Nó cũng giảm thiểu sự phát triển thêm của đề kháng. Bệnh nhân sẽ nhận được chăm sóc tốt hơn.

6.3. Đào tạo và Nâng cao Nhận thức về Kháng Carbapenem

Kết quả nghiên cứu cần được phổ biến rộng rãi. Các thông tin này phải đến được cán bộ y tế, sinh viên y khoa và cộng đồng. Việc này nâng cao nhận thức về mức độ nghiêm trọng của kháng carbapenem. Nó thúc đẩy việc sử dụng kháng sinh hợp lý. Tăng cường vệ sinh cá nhân và vệ sinh bệnh viện cũng là trọng tâm. Giáo dục là một công cụ mạnh mẽ. Nó giúp thay đổi hành vi và kiểm soát sự lan truyền của đề kháng kháng sinh.

Mục lục chi tiết luận án

LỜI CAM ĐOAN
LỜI CẢM ƠN
CÁC TỪ VIẾT TẮT
DANH MỤC CÁC HÌNH
DANH MỤC CÁC BẢNG
1. CHƯƠNG 1: Vi khuẩn Gram âm và tính kháng kháng sinh
1.1. Vi khuẩn Gram âm
1.2. Tính kháng kháng sinh của vi khuẩn Gram âm
1.3. Cơ chế kháng kháng sinh của vi khuẩn Gram âm. Cơ sở di truyền học của cơ chế kháng kháng sinh
1.4. Kháng sinh nhóm carbapenem và cơ chế kháng kháng sinh nhóm carbapenem của vi khuẩn Gram âm
1.4.1. Kháng sinh nhóm carbapenem
1.4.2. Cơ chế đề kháng kháng sinh nhóm carbapenem của vi khuẩn Gram âm
1.5. Một số phương pháp hiện đại ứng dụng trong nghiên cứu cơ chế đề kháng carbapenem ở mức độ phân tử và khả năng lan truyền của các chủng vi khuẩn mang gen kháng
1.5.1. Các phương pháp nghiên cứu đặc tính và cơ chế kháng carbapenem ở mức độ phân tử của các chủng vi khuẩn kháng thuốc
1.5.2. Các phương pháp nghiên cứu khả năng lan truyền của các chủng vi khuẩn mang gen kháng
1.6. Tình hình kháng kháng sinh nhóm carbapenem của vi khuẩn Gram âm trên thế giới và tại Việt Nam
1.6.1. Tình hình kháng kháng sinh nhóm carbapenem của vi khuẩn Gram âm trên thế giới
1.6.2. Tình hình kháng kháng sinh nhóm carbapenem của vi khuẩn Gram âm tại Việt Nam
2. CHƯƠNG 2: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
2.1. Địa điểm nghiên cứu
2.2. Thiết kế nghiên cứu
2.2.1. Thời gian và địa điểm thực hiện nghiên cứu
2.2.1.1. Thời gian thực hiện
2.2.1.2. Địa điểm thực hiện
2.2.2. Đối tượng nghiên cứu
2.2.3. Cỡ mẫu nghiên cứu
2.2.3.1. Cỡ mẫu cho mục tiêu 1
2.2.3.2. Cỡ mẫu cho mục tiêu 2
2.2.4. Sơ đồ tóm tắt các bước nghiên cứu
2.2.4.1. Sơ đồ tóm tắt các bước nghiên cứu đáp ứng mục tiêu 1
2.2.4.2. Sơ đồ tóm tắt các bước nghiên cứu đáp ứng mục tiêu 2
2.3. Phương pháp nghiên cứu
2.3.1. Trang thiết bị chính
2.3.2. Nuôi cấy và định danh lại vi khuẩn
2.3.3. Tách chiết ADN
2.3.4. Phản ứng chuỗi polymerase (PCR)
2.3.5. Giải trình tự gen
2.3.6. Thử nghiệm khả năng sinh enzyme carbapenemase của các chủng mang gen kháng bằng phương pháp Carba NP cải tiến (Carba NP - direct)
2.3.7. Thử nghiệm xác định nồng độ kháng sinh tối thiểu ức chế sự phát triển của vi khuẩn (MIC)
2.3.8. Kỹ thuật điện di xung trường (PFGE)
2.3.9. Kỹ thuật giải trình tự toàn bộ hệ gen của vi khuẩn (WGS)
2.3.10. Kỹ thuật S1-PFGE và Southern blot
2.3.11. Kỹ thuật tiếp hợp vi khuẩn để truyền plasmid
2.4. Xử lý và phân tích số liệu
2.5. Kiểm soát tính chính xác và độ tin cậy của các kỹ thuật trong quá trình nghiên cứu
2.6. Đạo đức trong nghiên cứu
3. CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ BÀN LUẬN
3.1. Một số đặc điểm chung của các chủng vi khuẩn phân lập tại 2 bệnh viện
3.2. Phát hiện sự có mặt của các gen mã hoá carbapenemase ở các chủng vi khuẩn kháng carbapenem phân lập tại 2 bệnh viện
3.3. Xác định khả năng sinh enzyme carbapenemase và mức độ nhạy cảm kháng sinh của các chủng vi khuẩn mang gen mã hoá carbapenemase
3.3.1. Xác định khả năng sinh enzyme carbapenemase của các chủng vi khuẩn mang gen mã hoá carbapenemase
3.3.2. Xác định mức độ nhạy cảm kháng sinh của các chủng vi khuẩn mang gen mã hoá carbapenemase theo tiêu chuẩn lâm sàng
3.4. Xác định mối liên hệ về kiểu gen của các chủng vi khuẩn mang gen mã hoá carbapenemase phân lập tại Bệnh viện Việt Đức và Bệnh viện Trung ương quân đội 108
3.4.1. Xác định mối liên hệ về kiểu gen của các chủng vi khuẩn sinh enzyme carbapenemase trong nghiên cứu bằng kỹ thuật PFGE
3.4.2. Xác định mối liên hệ về kiểu gen và sequence type của các chủng vi khuẩn sinh enzyme carbapenemase tại Việt Nam và trên thế giới bằng kỹ thuật giải trình tự toàn bộ hệ gen của vi khuẩn
3.5. Xác định cơ chế lan truyền qua trung gian plasmid của các chủng vi khuẩn mang gen mã hoá carbapenemase
3.5.1. Xác định đặc điểm của các plasmid mang gen mã hoá carbapenemase
3.5.2. Xác định khả năng lan truyền gen kháng qua trung gian plasmid giữa các chủng vi khuẩn
3.6. Xác định cấu trúc của các yếu tố di truyền di động mang gen mã hoá carbapenemase
3.6.1. Cấu trúc của các yếu tố di truyền di động mang gen blaKPC-2
3.6.2. Cấu trúc của các yếu tố di truyền di động mang gen blaNDM-1
3.6.3. Cấu trúc của các yếu tố di truyền di động mang gen blaOXA-48
3.6.4. Cấu trúc của yếu tố di truyền di động mang gen blaIMP-1
3.6.5. Cấu trúc của yếu tố di truyền di động mang gen blaOXA-23
MỞ ĐẦU
KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ
DANH MỤC CÔNG TRÌNH KHOA HỌC CỦA TÁC GIẢ ĐÃ XUẤT BẢN CÓ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN
TÀI LIỆU THAM KHẢO
PHỤ LỤC TÀI LIỆU
PHỤ LỤC 1: DANH SÁCH MẪU NGHIÊN CỨU VÀ KẾT QUẢ THEO MỘT SỐ NỘI DUNG CỦA MỤC TIÊU 1
PHỤ LỤC 2: DANH SÁCH MẪU NGHIÊN CỨU ĐƯỢC GIẢI TRÌNH TỰ TOÀN BỘ HỆ GEN CỦA MỤC TIÊU 2
PHỤ LỤC 3: BẢNG PHIÊN GIẢI KẾT QUẢ MIC THEO TIÊU CHUẨN CLSI 2017
Xem trước tài liệu
Tải đầy đủ để xem toàn bộ nội dung
Luận án tiến sĩ hus nghiên cứu ở mức độ phân tử khả năng kháng carbapenem của một số vi khuẩn gram âm phân lập từ bệnh nhân tại bệnh viện việt đức và bệnh viện trung ương quân đội 108

Tải xuống file đầy đủ để xem toàn bộ nội dung

Tải đầy đủ (201 trang)

Trích đoạn nội dung luận án

Tải xuống để đọc toàn bộ

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN TRẦN DIỆU LINH NGHIÊN CỨU Ở MỨC ĐỘ PHÂN TỬ KHẢ NĂNG KHÁNG CARBAPENEM CỦA MỘT SỐ VI KHUẨN GRAM ÂM PHÂN LẬP TỪ BỆNH NHÂN TẠI BỆNH VIỆN VIỆT ĐỨC VÀ BỆNH VIỆN TRUNG ƯƠNG QUÂN ĐỘI 108 LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC Hà Nội - 2018 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN TRẦN DIỆU LINH NGHIÊN CỨU Ở MỨC ĐỘ PHÂN TỬ KHẢ NĂNG KHÁNG CARBAPENEM CỦA MỘT SỐ VI KHUẨN GRAM ÂM PHÂN LẬP TỪ BỆNH NHÂN TẠI BỆNH VIỆN VIỆT ĐỨC VÀ BỆNH VIỆN TRUNG ƯƠNG QUÂN ĐỘI 108 Chuyên ngành: Vi sinh vật học Mã số: 62420107 LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: 1. Đặng Đức Anh 2. Phạm Văn Ty Hà Nội - 2018 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan: Đây là công trình nghiên cứu khoa học của riêng tôi, tất cả các kết quả và số liệu trong luận án do chính tôi thực hiện. Tất cả các số liệu trình bày trong luận án là trung thực, một phần đã được công bố trên các tạp chí khoa học trong nước và nước ngoài.

Phần còn lại trong luận án chưa được ai công bố trong bất kỳ công trình nghiên cứu nào khác. Tác giả của luận án Trần Diệu Linh LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com LỜI CẢM ƠN Lời đầu tiên tôi muốn bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc nhất tới GS. Đặng Đức Anh, Viện trưởng Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương, là người hướng dẫn khoa học, đã luôn giúp đỡ tôi, tận tình truyền đạt những kiến thức và kinh nghiệm quý báu để tôi có thể hoàn thành luận án. Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến GS.

Phạm Văn Ty, nguyên giảng viên Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội, là giáo viên đồng hướng dẫn, đã luôn nhiệt tình giúp đỡ, chỉ bảo động viên tôi trong quá trình học tập và thực hiện nghiên cứu để tôi có thể hoàn thành luận án này. Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến TS. Trần Huy Hoàng, Phó Trưởng khoa Vi khuẩn, Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương, là cố vấn khoa học trong suốt quá trình nghiên cứu, đã tận tình giúp đỡ, hướng dẫn tôi thực hiện các nghiên cứu, tạo điều kiện cho tôi hoàn thành luận án này. Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến GS.

Timothy Walsh, Trường Đại học Cardiff, Anh và TS. Masato Suzuki, Viện Nghiên cứu Quốc gia các Bệnh truyền nhiễm Nhật Bản đã hợp tác giải trình tự toàn bộ hệ gen vi khuẩn; TS. Rogier Van Doorm, Đơn vị nghiên cứu lâm sàng Trường Đại học Oxford Hà Nội (OUCRU) đã hỗ trợ phân tích kết quả, tạo điều kiện cho tôi hoàn thành luận án này. Tôi xin bày tỏ lòng cảm ơn chân thành tới các bạn đồng nghiệp của Phòng thí nghiệm Kháng sinh Khoa Vi khuẩn, Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương và OUCRU đã quan tâm, giúp đỡ, hỗ trợ tôi trong quá trình thực hiện nghiên cứu và hoàn thành luận án.

Tôi xin gửi lời trân trọng cảm ơn tới:  Ban giám đốc, Trung tâm Đảm bảo chất lượng xét nghiệm và Kiểm chuẩn, Khoa Vi khuẩn, Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương;  Ban giám đốc cùng toàn thể cán bộ Khoa Vi sinh vật và Khoa Sinh học phân tử, Bệnh viện Trung ương Quân đội 108;  Ban giám đốc cùng toàn thể cán bộ Khoa Vi sinh vật, Bệnh viện Hữu nghị Việt Đức. LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Cuối cùng tôi xin ghi nhớ công ơn sinh thành, nuôi dưỡng, dạy dỗ của cha mẹ tôi, cha mẹ chồng và sự ủng hộ, động viên, thương yêu, chăm sóc, khích lệ của chồng, con và các em, những người luôn ở bên tôi, là chỗ dựa vững chắc để tôi yên tâm học tập và hoàn thành luận án. Hà Nội, ngày tháng năm 2018. Trần Diệu Linh LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Nghiên cứu được thực hiện sử dụng kinh phí của các đề tài/dự án: - Đề tài cấp nhà nước "Đánh giá thực trạng kháng kháng sinh của vi khuẩn tại Việt Nam, xác định đặc điểm cấu trúc gen và yếu tố liên quan của các vi khuẩn kháng thuốc thường gặp ở Việt Nam" (Mã số: MOST: NHQT/SPĐP/02.

Trần Huy Hoàng chủ nhiệm. - Đề tài nhánh “Dịch tễ học phân tử của các chủng Enterobacteriaceae và Acinetobacter kháng carbapenem" thuộc Dự án "Phát triển và áp dụng các kỹ thuật chẩn đoán chuyên sâu một số bệnh truyền nhiễm tại Việt Nam" giữa Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương và Viện Nghiên cứu Quốc gia các Bệnh truyền nhiễm Nhật Bản giai đoạn 2016-2019 do TS. Trần Huy Hoàng chủ nhiệm. LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com MỤC LỤC MỤC LỤC .1 CÁC TỪ VIẾT TẮT .4 DANH MỤC CÁC HÌNH .7 DANH MỤC CÁC BẢNG.

Vi khuẩn Gram âm và tính kháng kháng sinh. Vi khuẩn Gram âm. Tính kháng kháng sinh của vi khuẩn Gram âm. Cơ chế kháng kháng sinh của vi khuẩn Gram âm.

Cơ sở di truyền học của cơ chế kháng kháng sinh. Kháng sinh nhóm carbapenem và cơ chế kháng kháng sinh nhóm carbapenem của vi khuẩn Gram âm. Kháng sinh nhóm carbapenem. Cơ chế đề kháng kháng sinh nhóm carbapenem của vi khuẩn Gram âm.

Một số phương pháp hiện đại ứng dụng trong nghiên cứu cơ chế đề kháng carbapenem ở mức độ phân tử và khả năng lan truyền của các chủng vi khuẩn mang gen kháng. Các phương pháp nghiên cứu đặc tính và cơ chế kháng carbapenem ở mức độ phân tử của các chủng vi khuẩn kháng thuốc. Các phương pháp nghiên cứu khả năng lan truyền của các chủng vi khuẩn mang gen kháng. Tình hình kháng kháng sinh nhóm carbapenem của vi khuẩn Gram âm trên thế giới và tại Việt Nam.

Tình hình kháng kháng sinh nhóm carbapenem của vi khuẩn Gram âm trên thế giới. Tình hình kháng kháng sinh nhóm carbapenem của vi khuẩn Gram âm tại Việt Nam. VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU. Địa điểm nghiên cứu.

Thiết kế nghiên cứu. Thời gian và địa điểm thực hiện nghiên cứu. Thời gian thực hiện. Địa điểm thực hiện.

Đối tượng nghiên cứu.55 1 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail. Cỡ mẫu nghiên cứu. Cỡ mẫu cho mục tiêu 1. Cỡ mẫu cho mục tiêu 2.

Sơ đồ tóm tắt các bước nghiên cứu. Sơ đồ tóm tắt các bước nghiên cứu đáp ứng mục tiêu 1. Sơ đồ tóm tắt các bước nghiên cứu đáp ứng mục tiêu 2. Phương pháp nghiên cứu.

Trang thiết bị chính. Nuôi cấy và định danh lại vi khuẩn. Tách chiết ADN. Phản ứng chuỗi polymerase (PCR).

Giải trình tự gen. Thử nghiệm khả năng sinh enzyme carbapenemase của các chủng mang gen kháng bằng phương pháp Carba NP cải tiến (Carba NP - direct). Thử nghiệm xác định nồng độ kháng sinh tối thiểu ức chế sự phát triển của vi khuẩn (MIC). Kỹ thuật điện di xung trường (PFGE).

Kỹ thuật giải trình tự toàn bộ hệ gen của vi khuẩn (WGS). Kỹ thuật S1-PFGE và Southern blot. Kỹ thuật tiếp hợp vi khuẩn để truyền plasmid. Xử lý và phân tích số liệu.

Kiểm soát tính chính xác và độ tin cậy của các kỹ thuật trong quá trình nghiên cứu. Đạo đức trong nghiên cứu. KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ BÀN LUẬN. Một số đặc điểm chung của các chủng vi khuẩn phân lập tại 2 bệnh viện.

Phát hiện sự có mặt của các gen mã hoá carbapenemase ở các chủng vi khuẩn kháng carbapenem phân lập tại 2 bệnh viện. Xác định khả năng sinh enzyme carbapenemase và mức độ nhạy cảm kháng sinh của các chủng vi khuẩn mang gen mã hoá carbapenemase. Xác định khả năng sinh enzyme carbapenemase của các chủng vi khuẩn mang gen mã hoá carbapenemase. Xác định mức độ nhạy cảm kháng sinh của các chủng vi khuẩn mang gen mã hoá carbapenemase theo tiêu chuẩn lâm sàng.

Xác định mối liên hệ về kiểu gen của các chủng vi khuẩn mang gen mã hoá carbapenemase phân lập tại Bệnh viện Việt Đức và Bệnh viện Trung ương quân đội 108 .92 2 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail. Xác định mối liên hệ về kiểu gen của các chủng vi khuẩn sinh enzyme carbapenemase trong nghiên cứu bằng kỹ thuật PFGE. Xác định mối liên hệ về kiểu gen và sequence type của các chủng vi khuẩn sinh enzyme carbapenemase tại Việt Nam và trên thế giới bằng kỹ thuật giải trình tự toàn bộ hệ gen của vi khuẩn. Xác định cơ chế lan truyền qua trung gian plasmid của các chủng vi khuẩn mang gen mã hoá carbapenemase.

Xác định đặc điểm của các plasmid mang gen mã hoá carbapenemase. Xác định khả năng lan truyền gen kháng qua trung gian plasmid giữa các chủng vi khuẩn. Xác định cấu trúc của các yếu tố di truyền di động mang gen mã hoá carbapenemase. Cấu trúc của các yếu tố di truyền di động mang gen blaKPC-2.

Cấu trúc của các yếu tố di truyền di động mang gen blaNDM-1. Cấu trúc của các yếu tố di truyền di động mang gen blaOXA-48. Cấu trúc của yếu tố di truyền di động mang gen blaIMP-1. Cấu trúc của yếu tố di truyền di động mang gen blaOXA-23 .133 DANH MỤC CÔNG TRÌNH KHOA HỌC CỦA TÁC GIẢ ĐÃ XUẤT BẢN CÓ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN.134 TÀI LIỆU THAM KHẢO .135 PHỤ LỤC TÀI LIỆU.

PHỤ LỤC 1: DANH SÁCH MẪU NGHIÊN CỨU VÀ KẾT QUẢ THEO MỘT SỐ NỘI DUNG CỦA MỤC TIÊU 1. PHỤ LỤC 2: DANH SÁCH MẪU NGHIÊN CỨU ĐƯỢC GIẢI TRÌNH TỰ TOÀN BỘ HỆ GEN CỦA MỤC TIÊU 2. PHỤ LỤC 3: BẢNG PHIÊN GIẢI KẾT QUẢ MIC THEO TIÊU CHUẨN CLSI 2017. 3 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com CÁC TỪ VIẾT TẮT Viết đầy đủ tiếng Anh Giải nghĩa tiếng Việt A.

Nội dung được bảo vệ bản quyền — Tải xuống đầy đủ

Trích dẫn luận án này

Trần Diệu Linh (2018). Nghiên cứu khả năng kháng carbapenem ở vi khuẩn Gram âm (2018) [Luận án tiến sĩ, Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội]. LuanAn.net. https://luanan.net/y-hoc/108

Câu hỏi thường gặp

Luận án "Nghiên cứu khả năng kháng carbapenem ở vi khuẩn Gram âm (2018)" nghiên cứu về vấn đề gì?

Nghiên cứu khả năng kháng carbapenem ở vi khuẩn Gram âm năm 2018, cung cấp dữ liệu quan trọng về tình trạng kháng kháng sinh nguy hiểm này.

Luận án "Nghiên cứu khả năng kháng carbapenem ở vi khuẩn Gram âm (2018)" được bảo vệ tại trường nào?

Luận án này được bảo vệ tại Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội. Năm bảo vệ: 2018.

Luận án "Nghiên cứu khả năng kháng carbapenem ở vi khuẩn Gram âm (2018)" thuộc chuyên ngành gì?

Luận án "Nghiên cứu khả năng kháng carbapenem ở vi khuẩn Gram âm (2018)" thuộc chuyên ngành Vi sinh vật học. Danh mục: Y Học.

Luận án "Nghiên cứu khả năng kháng carbapenem ở vi khuẩn Gram âm (2018)" có bao nhiêu trang?

Luận án "Nghiên cứu khả năng kháng carbapenem ở vi khuẩn Gram âm (2018)" có 201 trang. Bạn có thể xem trước một phần tài liệu ngay trên trang web trước khi tải về.

Cách tải luận án "Nghiên cứu khả năng kháng carbapenem ở vi khuẩn Gram âm (2018)" về máy như thế nào?

Để tải luận án về máy, bạn nhấn nút "Tải xuống ngay" trên trang này, sau đó hoàn tất thanh toán phí lưu trữ. File sẽ được tải xuống ngay sau khi thanh toán thành công. Hỗ trợ qua Zalo: 0559 297 239.

Luận án liên quan

Chia sẻ tài liệu: Facebook Twitter